Компьютерная программа для snt

Обновлено: 24.11.2024

Содержание этой страницы не проверялось с тех пор, как она была удалена из MediaWiki. Если вы хотите помочь, ознакомьтесь с руководством по оказанию помощи!

полная основа для количественной оценки анатомии нейронов

Обзор

SNT — это платформа ImageJ для полуавтоматического отслеживания, визуализации, количественного анализа и моделирования морфологии нейронов. Для отслеживания SNT поддерживает данные современной многомерной микроскопии и настраиваемые процедуры. Для анализа данных SNT предлагает расширенные инструменты визуализации, доступ ко всем основным базам данных морфологии и поддержку данных о схемах всего мозга. Он заменяет исходный подключаемый модуль Simple Neurite Tracer.

Документация SNT обширна. Пожалуйста, используйте панель навигации на странице, чтобы получить доступ к различным разделам. Основные разделы организованы следующим образом:

  • Руководство: руководство пользователя SNT по отслеживанию операций.
  • Пошаговые инструкции: подробные пошаговые инструкции для конкретных задач.
  • Скринкасты: видеоуроки. Если вы используете SNT в первый раз, вы, вероятно, захотите начать здесь
  • Средство просмотра реконструкции: точка входа SNT для визуализации ранее существовавших данных. Если вы анализируете реконструкции, вы можете начать здесь
  • Анализ Обзор всех команд анализа, доступных либо в интерфейсе трассировки, либо в средстве просмотра реконструкции.
  • Сценарии Подробная информация о том, как использовать SNT в качестве библиотеки сценариев

Обзор СНТ. Ключевой особенностью SNT является то, что каждый аспект программы может быть написан на любом из поддерживаемых Fiji языков или с Python через PyImageJ.

Возможности

Отслеживание

  • Поддержка многомерных изображений до 5D (включая многоканальные изображения и изображения с временной осью). Во время трассировки видимость неотслеживаемых каналов можно переключать по желанию
  • Точному размещению узлов помогает локальный поиск, который автоматически привязывает курсор к нейритам в трехмерном окружении.
  • Поиск по звездочке можно выполнить на втором, не отображаемом изображении. Это позволяет, например, отслеживать предварительно обработанное (отфильтрованное) изображение при взаимодействии с неотфильтрованным изображением (или наоборот). Если доступно достаточно оперативной памяти, переключение между двумя источниками данных происходит немедленно.
  • Трассировка поддерживается сценариями и может чередоваться с процедурами обработки изображений.
  • Пути можно помечать, искать, группировать и фильтровать по морфометрическим свойствам (длина, радиус и т. д.)
  • Пути можно редактировать, т. е. путь можно объединить с существующим или разделить на два. Узлы можно перемещать, удалять или вставлять.
  • Апостериорное уточнение позиционирования узла путем «привязки» трасс к флуоресцентному сигналу, связанному с путем.

Анализ

  • Обширный набор метрик, а именно те, которые предоставляются L-measure и NeuroM. Метрики можно собирать из групп ячеек, отдельных ячеек или их частей.
  • Анализ на основе аннотаций нейропиля для данных всего мозга, таких как MouseLight
  • Прямой доступ к общедоступным базам данных, включая MouseLight, FlyCircuit и NeuroMorpho
  • Встроенные команды для немедленного получения сводной статистики, сравнительных графиков и гистограмм
  • Обработка изображений. Реконструкции можно скелетировать, преобразовывать в маски или области интереса, а также профилировать интенсивность вокселей и анализировать Хортона-Стралера. Теория графов и анализ на основе стойкой гомологии
  • Моделирование: доступ к механизму моделирования Cx3D

Визуализация

    : Автономный инструмент 3D-визуализации с аппаратным ускорением как для сеток, так и для реконструкций.
    • Интерактивные и программные сцены (управляемые повороты, панорамирование, масштабирование, масштабирование, анимация, «темный/светлый режим» и т. д.)
    • Настраиваемые виды: интерактивное управление элементами сцены, элементы управления прозрачностью, интерполяцией цветов, освещением, сглаживанием контуров и т. д. Возможность рендеринга как локальных, так и удаленных файлов на одной сцене.
    • Встроенная поддержка нескольких шаблонов мозга: Drosophila, рыбок данио и Allen CCF (Allen Mouse Brain Atlas).

    Обратная совместимость

    • Особые усилия были приложены к обратной совместимости со старыми версиями Simple Neurite Tracer (включая взаимодействие TrakEM2 и ITK). Доработан наследуемый функционал, а именно:
      • Расширенная поддержка субпиксельной точности.
      • Улучшенная синхронизация представлений XY, ZY и XZ.
      • Улучшены вызовы процедур заполнения и подбора пути Дейкстры.
      • Улучшения многопоточности.

      Установка

      SNT в настоящее время распространяется через сайт обновлений нейроанатомии.При первом запуске SNT из структуры меню Fiji (Плагины > Нейроанатомия > SNT или его обратно-совместимый псевдоним Плагины > Нейроанатомия > Устаревшие > Simple Neurite Tracer…) вам будет предложено выполнить автоматическую подписку и загрузить необходимые зависимости. Если нет:

      1. Запустите Fiji Updater ( Help › Update.. , предпоследний пункт в меню «Справка»)
      2. Нажмите Управление сайтами обновлений
        3. .
      3. Установите флажок Нейроанатомия.
      4. Нажмите Применить изменения и перезапустите Fiji.

      Файлы с расширением .SNT содержат данные заметок, созданные в Windows Vista, Windows 7 и более поздних версиях Windows, собственной версии Sticky Notes. Они хранят одну или несколько заметок, включая текст, шрифт, цвет и положение на рабочем столе для каждой заметки, и позволяют сохранять заметки, даже если вы выходите из своей учетной записи.

      Отсутствует совместимость формата сохранения заметок между системами Windows. Вы можете открыть приложение, набрав «stukynot» в командной строке. По умолчанию файлы SNT не относятся к приложению, но расширение ему можно присвоить после выбора опции «Запустить с .» в контекстном меню файла и выбора приложения Sticky Notes в каталоге системных приложений, выбрав опцию чтобы всегда использовать приложение для их запуска. Файлы заметок по умолчанию сохраняются в каталоге C:Users[username]AppDataRoamingMicrosoftSticky Notes.

      Программы, которые могут открыть файл .SNT

      Окна

      Как открыть файлы SNT

      Если появилась ситуация, в которой Вы не можете открыть файл SNT на своем компьютере - причин может быть несколько. Первой и одновременно самой важной (встречается чаще всего) является отсутствие соответствующей аппликации обслуживающей SNT среди установленных на Вашем компьютере.

      Очень простой способ решить эту проблему — найти и загрузить соответствующее приложение. Первая часть задачи уже выполнена — программа, поддерживающая файл SNT, находится в таблице. Теперь просто скачайте и установите соответствующее приложение.

      Возможные проблемы с файлами формата SNT

      Невозможность открытия файла SNT и работы с ним, не обязательно означает, что мы не имеем установленного на своем компьютере соответствующего программного обеспечения. Могут быть и другие проблемы, которые также блокируют нашу способность работать с файлом формата данных Microsoft Windows Sticky Notes. Ниже приведен список возможных проблем.

      • Повреждение открываемого файла SNT
      • Неверные ссылки на файл SNT в записях реестра.
      • Случайное удаление описания расширения SNT из реестра Windows.
      • Неполная установка приложения, поддерживающего формат SNT
      • Открываемый файл SNT инфицирован нежелательным, вредным программным обеспечением.
      • На компьютере недостаточно аппаратных ресурсов, чтобы открыть файл SNT.
      • Драйверы оборудования, используемого компьютером для открытия файла SNT, устарели.

      Если вы уверены, что всех этих причин в вашем случае не существует (или они уже устранены), файл SNT должен без проблем работать с вашими программами. Если проблема с файлом SNT все же не решена, это может значить, что в этом случае появилась другая, редкая проблема с файлом SNT. В этом случае единственное, что вы можете сделать, это обратиться за помощью к профессиональным сотрудникам.

      Если у вас есть файлы SNT, которые нужно открыть, но вы не знаете, как это сделать, выполните следующие действия.

      Дополнительное предложение для File Magic от Solvusoft | ЛСКП | Политика конфиденциальности | Условия | Удалить

      Шаг 1. Дважды щелкните файл.

      Найдите значок файла SNT и дважды щелкните его. Если у вас установлена ​​нужная программа, она должна открыть файл автоматически. Если это не так, перейдите к шагу 2.

      Шаг 2. Найдите другую программу.

      Если файл SNT не открывается при двойном щелчке по нему, возможно, на вашем компьютере нет нужной программы. Существует несколько популярных программ, которые можно использовать для открытия файла SNT. Попробуйте одну из трех самых распространенных программ: Sticky Notes, Tonline E-mail Sent File или VISSDK Vislocalinfo File.

      Шаг 3. Проверьте тип файла.

      Если ни одна из вышеперечисленных программ не откроет ваш файл SNT, проверьте тип файла, чтобы убедиться, что у вас есть программа, которая может открыть этот тип файла. Большинство файлов SNT относятся к категории "Разные файлы", но есть вероятность, что это может быть другой тип.

      Эту информацию можно найти в свойствах файла. На компьютере с Windows просто щелкните файл правой кнопкой мыши, выберите «Свойства» и найдите тип файла в разделе «Тип файла». На компьютере Mac щелкните файл правой кнопкой мыши, выберите "Подробнее" и найдите тип файла в разделе "Тип".

      Шаг 4. Получите помощь от разработчика.

      Если вы не можете понять, как открыть файл SNT, разработчик, вероятно, скажет вам, как это сделать. Найдите программу в таблице ниже и свяжитесь с разработчиком этой программы.

      Имя программы Имя разработчика
      Sticky Notes Microsoft Corporation
      Отправленный файл по электронной почте Tonline Microsoft Programmer
      Файл VISSDK Vislocalinfo Microsoft Corporation

      Шаг 5. Найдите универсальное средство просмотра файлов.

      Самый простой способ открыть файл SNT или любой другой файл — использовать универсальный просмотрщик файлов, например File Magic (Download). Вы можете использовать его для открытия многих различных форматов файлов. Если он несовместим, файл просто откроется в двоичном формате.

      Рекомендуемая загрузка

      Дополнительное предложение для File Magic от Solvusoft | ЛСКП | Политика конфиденциальности | Условия | Удалить

      Открывает все ваши файлы
      КАК ВОЛШЕБНО! 1

      Дополнительное предложение File Magic от Solvusoft
      EULA | Политика конфиденциальности | Условия | Удалить

      1 Неподдерживаемые типы файлов можно открывать в двоичном формате.

      Просмотреть файлы

      Вы загружаете пробную версию программного обеспечения. Чтобы разблокировать все функции программного обеспечения, необходимо приобрести годовую подписку на программное обеспечение по цене 39,95 долларов США. Подписка автоматически продлевается в конце срока (Подробнее). Нажимая кнопку «Загрузить» выше и устанавливая «File Magic», я подтверждаю, что прочитал и согласен с Лицензионным соглашением с конечным пользователем File Magic и Политикой конфиденциальности.

      Многие люди делятся файлами .snt, не прикрепляя инструкции по их использованию. Однако не для всех очевидно, с помощью какой программы можно редактировать, конвертировать или печатать файл .snt. На этой странице мы пытаемся помочь в работе с файлами .snt.

      В нашей базе данных найдено 3 расширения имени файла.

      .snt — стикеры для Windows

      Другие файлы SNT связаны с Sticky Notes. Файл SNT представляет собой заметки Windows Sticky Notes. Sticky Notes – это программа, позволяющая создавать публикации прямо на рабочем столе.

      Приложение: Sticky Notes Категория: Другие файлы Mime-тип: application/octet-stream Магия: - / - Псевдонимы: - Windows Расширения, связанные с Sticky Notes: .website Ярлык прикрепленного сайта Internet Explorer .gfs Groove File Sharing File .wlms Windows Сценарий Live Movie Maker .wlmx Эффект Windows Live Movie Maker .partial Частично загруженный файл Internet Explorer .shs Файл отходов оболочки

      .snt – аудиоконфигурация Amnesia: The Dark Descent

      Файлы игровых данных SNT относятся к Amnesia: The Dark Descent. Файл SNT представляет собой аудиоконфигурацию Amnesia: The Dark Descent. Amnesia: The Dark Descent — это приключенческая видеоигра в жанре ужасов на выживание, разработанная Frictional Games.

      .vxs — слайд-шоу VX Show-n-Tell

      Файлы документов VXS связаны с VX Show-n-Tell. Файл VXS представляет собой слайд-шоу VX Show-n-Tell. VX Show-n-Tell больше не поддерживается.

      Приложение: VX Show-n-Tell Категория: Файлы документов Mime-тип: application/octet-stream Магия: - / - Псевдонимы: snt VX Show-n-Tell Slideshow связанные расширения: .asd Alphacam Stone Drawing .luf Lipikar Документ единого формата .cbtx Шаблон Comic Book Creator .mbk Резервная копия макросов SmartWare .gpl Входной файл Gnuplot .cg Guitar Chord Groover Chord

      Разумеется, другие приложения также могут использовать расширение файла .snt. Даже вредоносные программы могут создавать файлы .snt. Будьте особенно осторожны с файлами .snt из неизвестного источника!

      Не удается открыть файл .snt?

      Когда вы дважды щелкаете файл, чтобы открыть его, Windows проверяет расширение имени файла. Если Windows распознает расширение имени файла, она открывает файл в программе, связанной с этим расширением имени файла. Если Windows не распознает расширение имени файла, вы получите следующее сообщение:

      Windows не может открыть этот файл:

      Чтобы открыть этот файл, Windows необходимо знать, какую программу вы хотите использовать для его открытия. Windows может выйти в Интернет для автоматического поиска, или вы можете вручную выбрать программу из списка программ, установленных на вашем компьютере.

      Чтобы избежать этой ошибки, необходимо правильно установить ассоциацию файлов.

      • Откройте "Панель управления" > "Главная страница панели управления" > "Программы по умолчанию" > "Установить связи".
      • Выберите тип файла в списке и нажмите «Изменить программу».

      Расширение файла .snt часто указывается неверно!

      Согласно поисковым запросам на нашем сайте, эти орфографические ошибки были наиболее распространенными в прошлом году:

      cnt, ent, nst, nt, qnt, sbt, sgt, sht, smt, sn, snf, sng, snr, st, stn

      Возможно ли, что расширение имени файла написано с ошибкой?

      Похожие расширения файлов в нашей базе данных:

      .qnt Метод количественной оценки Chromeleon .sng Korg Trinity Song .stn Подлинное изображение фракталов STN .snr Mail.dat Seed Name File .sng n-Track Записанная песня .stn ArcView Geocoding Standardization

      Операционные системы

      Windows XP/Vista, Windows 7/8, Windows 10, CentOS, Debian GNU/Linux, Ubuntu Linux, FreeBSD, Mac OS X, iOS, Android

      Если информация на этой странице окажется для вас полезной, пожалуйста, разместите на ней ссылку.

      Если у вас есть полезная информация о формате файла .snt, напишите нам!

      Читайте также: