Какой путь к файлу 10a txt из корневого каталога правильный

Обновлено: 03.07.2024

Удобным способом загрузки нескольких файлов из GDC является использование файла манифеста, созданного порталом данных GDC. После создания файла манифеста (см. инструкции в разделе Подготовка к загрузке и выгрузке данных) инициируйте загрузку с помощью средства передачи данных GDC, указав параметр -m или --manifest, а затем расположение и имя файла манифеста. Пользователи OS X могут перетащить файл манифеста в терминал, чтобы указать его местоположение.

Ниже приведен пример команды для загрузки файлов с GDC с помощью файла манифеста:

Загрузка данных с использованием UUID файла GDC

Инструмент передачи данных GDC также поддерживает загрузку одного или нескольких отдельных файлов с использованием UUID вместо файла манифеста. Для этого введите UUID после команды загрузки:

Можно указать несколько UUID, разделенных пробелом:

Возобновление неудачной загрузки

Инструмент передачи данных GDC поддерживает возобновление прерванных загрузок. Чтобы возобновить незавершенную загрузку, повторите загрузку манифеста или UUID в ту же папку, что и первоначальная загрузка. Неудачные загрузки появятся в папке назначения с расширением .partial. Эта функция позволяет пользователям быстро определить, где остановилась загрузка. Для больших загрузок эта функция позволяет пользователю определить, где загрузка была прервана, и соответствующим образом отредактировать манифест.

Загрузить последнюю версию файла

Инструмент передачи данных GDC поддерживает управление версиями файлов. Наше серверное хранилище данных поддерживает несколько версий файлов, поэтому старые и текущие версии могут быть доступны для наших пользователей. Для получения информации о доступе к информации о версиях файлов с помощью нашего API и поиске более старой информации UUID из текущих UUID, пожалуйста, ознакомьтесь с разделом «Руководство пользователя API» в нашей документации по API. При работе со старыми манифестами или старыми списками UUID последнюю версию файла всегда можно загрузить с флагом --latest.

Загрузка данных контролируемого доступа

Для загрузки данных контролируемого доступа из GDC требуется токен аутентификации пользователя. Токены можно получить на портале данных GDC (см. инструкции в разделе Получение токена аутентификации). После загрузки файл токена можно передать в инструмент передачи данных GDC с помощью параметра -t или --token-file:

Структура каталогов загружаемых файлов

Каталог, в который загружаются файлы, будет включать папки, названные по UUID файла. Внутри этих папок, наряду с данными и заархивированными метаданными или индексными файлами, будет существовать папка журналов. Папка журналов содержит файлы состояния, которые обеспечивают точность загрузок и позволяют возобновить неудачные или преждевременно остановленные загрузки. Во время загрузки файл будет иметь расширение .partial. Это также останется, если загрузка не удалась. После завершения загрузки файла расширение будет удалено. При повторном использовании идентичного манифеста будет предпринята еще одна попытка загрузить файлы с расширением .partial.

Загрузки

Загрузка данных с помощью файла манифеста

Инструмент передачи данных GDC поддерживает загрузку молекулярных данных с помощью файла манифеста на портал отправки данных. Файл манифеста для файлов данных, подлежащих отправке, можно получить с портала отправки данных GDC или непосредственно из API отправки данных GDC с учетом UUID файла данных для отправки. Файл маркера аутентификации пользователя необходимо указать с помощью параметра -t или --token-file.

Сначала создайте манифест загрузки либо с помощью портала отправки данных GDC, либо с помощью вызова конечной точки манифеста API отправки GDC (как в следующем примере):

Загрузка данных с использованием UUID файла GDC

Инструмент передачи данных GDC также поддерживает загрузку молекулярных данных с использованием UUID файла. Инструмент сначала сделает запрос на получение имени файла и идентификатора проекта из API GDC, а затем загрузит соответствующий файл из текущего каталога.

Возобновление неудачной загрузки

По умолчанию инструмент передачи данных GDC использует многокомпонентную передачу для загрузки файлов. Если загрузка не удалась, но некоторые части были переданы успешно, файл резюме будет сохранен с именем файла resume_[manifest_filename]. Повторный запуск команды загрузки возобновит передачу только тех частей файла, которые не удалось загрузить при предыдущей попытке.

Удаление ранее загруженных данных

Ранее загруженные данные можно заменить новыми, предварительно удалив их с помощью параметра --delete:

Устранение неполадок

Недопустимый токен

Сообщение об ошибке о «недействительном токене» означает, что необходимо получить новый токен аутентификации с портала данных GDC или портала отправки данных GDC, как описано в разделе «Подготовка к загрузке и выгрузке данных».

Ошибка разрешений dbGaP

При попытке загрузить файл с GDC пользователи могут увидеть следующее сообщение об ошибке:

Это сообщение об ошибке указывает на то, что у пользователя нет доступа dbGaP к проекту, которому принадлежит файл. Инструкции по запросу доступа от dbGaP можно найти здесь.

Ошибка доступности файла

Пользователи также могут увидеть следующее сообщение об ошибке при попытке загрузить файл с GDC:

Это сообщение об ошибке означает, что файл недоступен для загрузки. Это может быть связано с тем, что файл еще не был загружен или выпущен, или что он не является файловым объектом.

Ошибка прав загрузки GDC

При попытке загрузить файл пользователи могут увидеть следующее сообщение об ошибке:

Это означает, что у пользователя есть доступ для чтения данных по dbGaP, но нет прав на загрузку GDC. Пользователи могут обратиться в базу данных генотипов и фенотипов (dbGaP), чтобы запросить права на загрузку.

Ошибка загрузки файла

Повторная загрузка файла может вернуть следующую ошибку:

Чтобы решить эту проблему, перед повторной загрузкой удалите файл с помощью параметра --delete.

Ошибка исполняемого файла Microsoft Windows

При попытке запустить gdc-client.exe, дважды щелкнув его в проводнике Windows, появится окно, которое мигнет один раз и исчезнет.

Это нормально, исполняемый файл необходимо запускать с помощью командной строки. Нажмите «Пуск», затем «Выполнить» и введите «cmd» в текстовую строку. Затем перейдите к пути, содержащему исполняемый файл, с помощью команды «cd».

Справочное меню

Инструмент передачи данных GDC поставляется со встроенным меню справки. Эти меню отображаются, когда инструмент передачи данных GDC запускается с флагами -h или --help для любого из основных аргументов инструмента. Запуск инструмента передачи данных GDC без аргумента или флага отобразит список доступных параметров команды.

Основное меню

Инструмент передачи данных GDC отображает следующий вывод при выполнении без каких-либо аргументов.

Скачать меню справки

Инструмент передачи данных GDC отображает следующее меню справки по функциям загрузки.

Меню загрузки справки

Инструмент передачи данных GDC отображает следующее меню справки по функциям загрузки.

Файл конфигурации инструмента передачи данных

DTT позволяет сохранять и повторно использовать параметры конфигурации в формате простого текстового файла с помощью аргумента командной строки. Сначала необходимо создать простой текстовый файл с расширением txt или dtt. Поддерживаемые заголовки разделов загрузки и загрузки могут использоваться независимо друг от друга или использоваться в одном и том же файле конфигурации. Каждый заголовок раздела соответствует основным функциям приложения, которые заключаются либо в загрузке данных с порталов GDC, либо в загрузке данных в систему представления GDC. Настраиваемые параметры — это те, которые перечислены в меню справки в разделе «Загрузка» или «Выгрузка», отображаемые на вкладках вывода.

Пример файла конфигурации:

Отображение параметров конфигурации

Этот флаг командной строки можно использовать с функцией загрузки или загрузки приложения, чтобы показать, какие настройки активны в пользовательском файле конфигурации инструмента передачи данных.

Окно загрузки

Окно загрузки xv позволяет загружать и просматривать изображения в интерактивном режиме, не указывая их в командной строке при запуске xv. Хотя визуальный шнауцер сделал его несколько устаревшим, окно загрузки xv стало значительно быстрее.

В окне загрузки отображается содержимое текущего каталога в прокручиваемом окне. Файлы будут отсортированы в алфавитном порядке, каждый из которых имеет небольшой значок, указывающий тип файла (каталог, исполняемый файл или обычный файл).

Это окно списка работает так же, как окно управления xv. (Подробности см. в разделе «Работа с окном списка».) Короче говоря, вы можете управлять полосой прокрутки, перетаскивать полосу выделения по окну и использовать кнопки , , , ,

клавиши на клавиатуре.

Каждый раз, когда вы нажимаете имя в списке (или иным образом меняете положение полосы выделения), имя выделенного файла копируется в область ввода текста "Загрузить файл", расположенную под окном списка. Нажатие кнопки Ok (или нажатие ) заставит xv попытаться загрузить указанный файл. Если попытка загрузки успешна, окно загрузки исчезнет и отобразится новое изображение. В противном случае появится сообщение об ошибке, а окно загрузки останется видимым.

Флажок "Обзор" переопределяет это поведение и сохраняет окно загрузки видимым до тех пор, пока оно не будет явно закрыто (через кнопку "Отмена"). Это удобно, если вы используете xv для «прогулки по дереву каталогов» и планируете довольно часто использовать команду «Загрузить». (Хотя лучшим способом, вероятно, было бы использование визуального шнауцера.)

Если изображение успешно загружено, его имя будет добавлено в список окна элементов управления xv.Это позволит вам быстро перезагрузить его позже без необходимости снова проходить через окно загрузки xv.

Вы также можете загрузить файл, дважды щелкнув его имя в списке файлов.

Если указанное имя файла начинается с '!' или '|' символ, имя файла будет интерпретировано как запускаемая команда оболочки. Ведущий '!' или '|' отбрасывается, а остальная часть строки передается в системную оболочку по умолчанию. Ожидается, что команда сгенерирует изображение в одном из форматов, распознаваемых xv, в качестве стандартного вывода. Если команда возвращает ненулевое значение, xv считает, что она не удалась, и не пытается прочитать полученный вывод. Вы можете связать несколько команд вместе. Например, загрузка «! xwd | xwdtopnm» запустит xwd для создания дампа окна, передаст его в xwdtopnm для преобразования в файл PPM, и этот файл будет передан в xv .

Если указанный файл является каталогом, xv обнаружит это и (вместо загрузки) перейдет в этот каталог и отобразит его содержимое в окне списка.

Над окном со списком находится кнопка всплывающего меню. Обычно он отображает имя текущего каталога. Если вы нажмете эту кнопку и будете удерживать кнопку мыши, будет показан полный путь, по одному каталогу в строке. Вы можете подняться вверх по дереву каталогов на любое количество уровней вплоть до корневого каталога, просто выбрав имя каталога в этом списке.

Для тех, кто предпочитает прямой подход, вы можете просто ввести имена файлов или каталогов в текстовую область ввода "Загрузить файл". Если вы наберете имя каталога и нажмете , xv перейдет в этот каталог и отобразит его содержимое в окне списка. Если вы наберете имя файла и нажмете , xv попытается загрузить файл. Вы можете вводить относительные пути (относительно текущего отображаемого каталога), абсолютные пути и даже пути, начинающиеся с «~».

Область ввода текста "Загрузить файл" поддерживает ряд клавиш редактирования, подобных emacs: f перемещает курсор вперед на один символ b перемещает курсор назад на один символ a перемещает курсор в начало строки e перемещает курсор в конец строки d удаляет символ справа от курсора u очищает всю строку k очищает от позиции курсора до конца строки. Завершение имени файла. Примечание. Он может заполнять только «простые» имена файлов (без символов «/»)

Если имя файла настолько длинное, что его нельзя полностью отобразить в области ввода текста, слева или справа (или с обеих сторон) области появится толстая линия, показывающая, что "здесь есть еще что-то" .

Нажатие кнопки "Повторное сканирование" приведет к повторному сканированию текущего каталога. Хотя содержимое текущего каталога считывается каждый раз при открытии окна загрузки, вполне возможно (при наличии многозадачной операционной системы), что какая-то другая программа может добавлять, удалять или переименовывать файлы в текущем каталоге. xv не знал бы, если бы это произошло. Кнопка «Повторное сканирование» дает вам простой способ «подтолкнуть» xv к повторному просмотру. Кнопка «Загрузить все» просто копирует имена всех «обычных файлов», найденных в текущем каталоге, в список имен файлов элементов управления xv, где у вас есть кнопки «Далее» и «Предыдущий», которые помогут вам просмотреть список файлов. Этот документ был извлечен из документации PostScript и отформатирован Роем Джонсоном. Большая часть процесса была автоматизирована, поэтому могли возникать ошибки. Исправления приветствуются.

D) программа, служащая для подключения устройств ввода/вывода.

Б) только другие папки;

В) файлы и папки;

<р>7. Папка, в которой хранятся все папки и файлы, называется:

<р>8. Имя C: имеет:

<р>9. Какой путь из корневого каталога правильный:

A) A:\Learners\Field of Wonders\pole .exe ;

B) \Learners\Field of Wonders\ pole .exe ;

B) A:\Обучающие программы\Поле чудес\;

D) A: Студенты Поле Чудес.

<р>10. Полное имя файла C :\DOC │PROBA .TXT .Какое имя файла?

ТЕСТ ПО ТЕМЕ "ФАЙЛОВАЯ СИСТЕМА"

Ф.И. __________________________________________ КЛАСС________ Вариант 2

А) единица измерения информации;

C) текст, распечатанный на принтере;

D) программа или данные на диске с именем.

<р>2. Какие имена файлов правильные:

C) пример text.doc ;

<р>3. Укажите тип файла .exe

<р>4. Укажите расширение файла disk .dat :

<р>5. Файловая система обычно изображается в виде дерева, где «ветви» — это каталоги (папки), а «листья» — это файлы. Что может располагаться непосредственно в корневом каталоге, т.е. на "стволе" дерева?

А) файлы и папки;

<р>6. Тип файла обозначается:

а) расширение файла

C) путь к файлу;

D) имя файла.

<р>7. Папка, которая находится внутри другой папки, называется:

<р>8. Имя А: имеет:

A) дисковод гибких дисков

<р>9. Полное имя файла C:\ DOC │PROBA .TXT .Какое имя файла?

<р>10. Какой правильный путь к файлу 10a.txt из корневого каталога:

A) C:\Мои документы\10a\10a.текст ;

B) Мои документы\10a\10a.txt;

В) C:\Мои документы\10a\;

D) C: Мои документы 10a 10a.txt;

Тест по теме: "Файловая система" Вариант 1

<р>1. Файловая система:

A) системная программа; Б) вложенная файловая структура;

C) структура вложенных папок; D) структура вложенных папок и файлов.

<р>2. Именованная группа байтов на диске называется:

А) диск Б) каталог; Б) папка Г) файл.

<р>3. Какие имена файлов правильные:

А) "пример". документ; Б) вложенная файловая структура; Б) док.?пример; Б) вложенная файловая структура; Г) пример: документ.

<р>4. Укажите расширение файла Моя первая программа - .dos:

A) без расширения B) dos; Б) это. документ; Г) .doc.

<р>5. Укажите тип файлаProba. HTML:

А) текст Б) веб-страница

Б) графика; г) исполняемый файл.

<р>6. Папка:

A) средство организации тематически связанных файлов;

Б) именованная область диска;

C) программа, переводящая язык программирования в машинный код;

D) программа, служащая для подключения устройств ввода/вывода.

A) только файлы; б) только другие папки; в) файлы и папки; Г) Окна Windows.

<р>8. Папка, в которой хранятся все папки и файлы, называется:

А) основной; Б) корень; Б) основной Г) вложенный.

<р>9. Имя C: имеет:

A) дисковод для гибких дисков B) жесткий диск

Б) дисковод для компакт-дисков; Г) файл.

<р>10. Какой путь из корневого каталога правильный:

A) A:\Учебники\Поле Чудес\Роли. исполняемый файл;

Б) \ Учебники \ Поле Чудес \ Роль. исполняемый файл;

C) A:\Учебники\Поле Чудес\;

D) A: Учебники Поле Чудес.

<р>11. Полное имя файла C:\DOS\PROBA.TXT. Каково настоящее имя файла?

А) РОБА; В) ДОК\ПРОВА. текстовое сообщение;

Б) РРОВА. ТЕКСТ; Г) текстовое сообщение.

Тест по теме: "Файловая система" Вариант 2

<р>1. Файл:

А) единица измерения информации; Б) программа в ОЗУ; в) текст, распечатанный на принтере; Г) программа или данные на диске, у которых есть имя.

<р>2. Какие имена файлов правильные:

A) пример?.doc; в) образец текста. документ; Б) пример: txt; Г) ?пример?.doc.

<р>3. Укажите типы файлов ani.exe

А) текст Б) исполняемый файл

Б) графика; г) видео.

<р>4. Укажите расширение файла disk. документ:

б) диск. документ; г) без расширения.

<р>5. Файлы, которые имеют некоторые общие черты, сохраняются:

А) в реестрах; Б) дисководы Б) в папках; Г) диски.

<р>6. Файловая система обычно изображается в виде дерева, где «ветви» — это каталоги (папки), а «листья» — это файлы. Что может располагаться непосредственно в корневом каталоге, т.е. на «стволе» дерева?

А) папки и файлы; в) только файлы;

Б) только папки; Г) ничего.

<р>7. Тип файла обозначается:

A) файл с расширением ; IN) путь к файлу;

Б) имя файла; Г) имя файла.

<р>8. Папка, которая находится внутри другой папки, называется:

А) основной; Б) корень; Б) основной; Г) вложенный

<р>9. Имя А: имеет:

A) дисковод для гибких дисков B) дисковод для компакт-дисков;

B) жесткий диск D) файл.

<р>10. Полное имя файла C:\DOS|RROVA.txt. Как называется каталог, в котором находится этот файл?

А) C:\DOC\PROBA. текст; Б) ДОК; Б) РКОВА. текст; г) текст

<р>11. Какой путь к файлу 10 класс из корневого каталога правильный:

A) С:\ Мои документы\ 10 класс\ 10 класс. текст; Б) Мои документы\10 класс\10 класс. текст; В) С:\Мои документы\10 класс\ ;

D) C: Мои документы 10 класс 10 класс. текст;

Ответы на тест "Структура файла"

< бр />

Цель. Проверка знаний понятий по теме, навыков работы с файловой системой.

Чтобы выбрать ответ на вопрос, щелкните левой кнопкой мыши выбранный вариант.

Если у вас есть вопросы, воспользуйтесь разделом

Что вам нужно знать

< бр />

1 . Файловая система:

  • системная программа;
  • Вложенная файловая структура;
  • Структура вложенных папок
  • Вложенная структура файлов и папок.

Что вам нужно знать

< br />

<р>2. Именованная группа байтов на диске называется:

Что вам нужно знать


<р>3. Какое имя файла правильное?

Что вам нужно знать

< бр /> <р>4. Укажите тип файла Proba.html

Что вам нужно знать

< бр /> <р>5. Полное имя файла указано C:\DOC\Proba.txt. Как называется файл?

Что вам нужно знать

< бр /> <р>6. Папка, в которой хранятся все папки и файлы, называется:

Что вам нужно знать

< бр /> <р>7. Какой путь из корневого каталога правильный?

Что вам нужно знать

< бр />

Что вам нужно знать

< бр /> <р>9. Определите, какое из указанных имен файлов соответствует маске: ?hel*lo.c?*

Что вам нужно знать

< бр /> <р>10 . Переходя из одного каталога в другой, пользователь последовательно посещал каталоги DOC, USER, SCHOOL, A:\, LETTER, INBOX. При каждом перемещении пользователь либо опускался в каталог на один уровень ниже, либо поднимался на один уровень выше. Каково полное имя каталога, из которого пользователь начал перемещение?

Присоединяйтесь к ResearchGate, чтобы задавать вопросы, получать отзывы и продвигать свою работу.

Последний ответ


< /p>

Talvez alguém já tenha responseido isso anteriormente, mas o problema pode estar na extensão do arquivo, o arquivo excel a ser lido pode não estar na extensão .csv

Популярные ответы (1)


Спасибо за помощь. Я нашел каталог с помощью getwd(), и мне пришлось указать полный путь к файлу CSV, например. read.csv("C:/R/P506A-data-time-v3.csv", заголовок = TRUE)

Все ответы (16)


Это корень жесткого диска? Если это сетевой диск или около того, он может быть недоступен напрямую или около того. Я больше не разбираюсь в Windows так хорошо, используя Mac.


< /p>


< /p>


Спасибо за помощь. Я нашел каталог с помощью getwd(), и мне пришлось указать полный путь к файлу CSV, например. read.csv("C:/R/P506A-data-time-v3.csv", заголовок = TRUE)


Спасибо, Ана, это меня тоже очень расстроило. Почему я вообще удосужился установить рабочий каталог, я не знаю




< /p>




У меня есть 55 файлов ".wav" в каталоге. При чтении всех файлов .wav он не может получить первый файл .wav, хотя файл .wav существует в пути. Выдает следующую ошибку:


У меня постоянно появлялось это сообщение с некоторыми файлами. Мои файлы были в папке R, и большую часть времени они работали нормально. Затем я просто использовал:


Похожие вопросы и обсуждения

Анди Нур Ниламьяни

Я пытаюсь нормализовать данные своего микрочипа Affymetrix в R с помощью пакета affy. Но я получаю предупреждение об ошибке: невозможно выделить вектор размером 1,2 ГБ. Есть ли кто-нибудь, кто знает, как это решить? Можете ли вы сказать мне решение, пожалуйста.

Панкадж Кумар

Я хочу знать о "МЕСЯЦЕ в 2021 году", когда JCR I.F. вместе с квартильным рейтингом журнала будет опубликован. Пожалуйста, сообщите, если у вас есть какие-либо идеи.

Я хочу спросить, хорошо ли публиковаться в журналах MDPI, а точнее, как обстоят дела с публикациями в "International Journal of Molecular Sciences"?

Асиф Али

Возможно ли получить незначимые результаты в апостериорном тесте, когда мы получили значимый результат в ANOVA?

Umesh Wadgave< бр />

Я получил значительные результаты после теста ANOVA, но когда я применил апостериорный тест Тьюки, я получил незначительные результаты. Я не мог этого объяснить.

Сейчас я работаю со смешанной моделью (lme) в программном обеспечении R. Модель имеет два фактора (случайный и фиксированный); фиксированный коэффициент (4 уровня) имеют р

Алехандро Рос-Гальвес

Kang Liang< бр />

Мы знаем, что обобщенные линейные модели (GLM) представляют собой широкий класс моделей. При настройке GLM в R нам нужно указать, какую семейную функцию использовать из набора параметров, таких как гауссовская, пуассоновская, биномиальная, квази и т. д. Я хотел бы получить ваш совет относительно того, как определить дополнительную семейную функцию, используемую для подбора GLM. в R. Спасибо!

Судип Мудхулу< бр />

Mriganka Shekhar Sarkar

Привет, я работаю с большими наборами пространственных данных (около 15 ГБ растровых файлов) в R. Для любого типа вычислений (запущенная программа) R показывает сообщение об ошибке "невозможно выделить вектор размером ---ГБ". Я знаю, что это проблема размера оперативной памяти ПК, поскольку R по умолчанию использует оперативную память для вычисления любого анализа. Однако есть ли другой альтернативный способ решения этой проблемы без увеличения оперативной памяти компьютера?

Читайте также: